Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB3PQ58FF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms