Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms