Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms