Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC39A12Q504Y0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms