Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms