Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms