Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms