Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B9

YOR008C-A, Uncharacterized protein YOR008C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR008C-AQ3E7B9 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.97□□□□□ -2.56
YOR008C-AQ3E7B9 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.97□□□□□ -2.56
YOR008C-AQ3E7B9 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.97□□□□□ -2.56
YOR008C-AQ3E7B9 COG6YNL041C 2520 nt-0.97□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 PAA1YDR071C 576 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 LSM4YER112W 564 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 TIM13YGR181W 318 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YJL120WYJL120W 324 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 ATG31YDR022C 591 nt-0.99□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 RSM18YER050C 417 nt-0.99□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YOR248WYOR248W 303 nt-0.99□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-1□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 CMS1YLR003C 876 nt-1□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YLR287CYLR287C 1068 nt-1□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 snR36snR36 182 nt-1□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YDR290WYDR290W 330 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YJL086CYJL086C 369 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.02□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YLR171WYLR171W 390 nt-1.02□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-1.03□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-1.03□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 PCF11YDR228C 1881 nt-1.03□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 SPO21YOL091W 1830 nt-1.03□□□□□ -2.57
YOR008C-AQ3E7B9 GPX1YKL026C 504 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 BLS1YLR408C 369 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-1.05□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YHR054CYHR054C 1065 nt-1.05□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YML108WYML108W 318 nt-1.05□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.05□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 MRPS8YMR158W 468 nt-1.05□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.07□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 GLG1YKR058W 1851 nt-1.07□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YDR269CYDR269C 324 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 EMC4YGL231C 573 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 THG1YGR024C 714 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 EST1YLR233C 2100 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 RPS25BYLR333C 327 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 RPS10BYMR230W 318 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 DCP1YOL149W 696 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 DFG10YIL049W 762 nt-1.09□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YBR099CYBR099C 384 nt-1.09□□□□□ -2.58
YOR008C-AQ3E7B9 YER079WYER079W 633 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 IRC16YPR038W 360 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 SDH7YDR511W 402 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 YHR138CYHR138C 345 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 RUF20RUF20 443 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 YOL160WYOL160W 342 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 SVS1YPL163C 783 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 snR72snR72 98 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 PBI2YNL015W 228 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 YPR092WYPR092W 306 nt-1.13□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 GRX5YPL059W 453 nt-1.14□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 LRP1YHR081W 555 nt-1.15□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 VPS63YLR261C 327 nt-1.15□□□□□ -2.59
YOR008C-AQ3E7B9 snR59snR59 78 nt-1.16□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YGR228WYGR228W 345 nt-1.16□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 POL32YJR043C 1053 nt-1.16□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YNL171CYNL171C 369 nt-1.16□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 CWC23YGL128C 852 nt-1.17□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YKL111CYKL111C 336 nt-1.18□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 LIN1YHR156C 1023 nt-1.19□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YOL029CYOL029C 606 nt-1.19□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YPL261CYPL261C 309 nt-1.19□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 SNU13YEL026W 381 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 LOC1YFR001W 615 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 RPS20YHL015W 366 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YIR044CYIR044C 186 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-1.21□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.21□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 YOL106WYOL106W 354 nt-1.21□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.22□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 RPF1YHR088W 888 nt-1.22□□□□□ -2.6
YOR008C-AQ3E7B9 AI5_BETAQ0075 1065 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 POP6YGR030C 477 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 BLI1YKL061W 342 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YLR041WYLR041W 321 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 SPC24YMR117C 642 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 SGF11YPL047W 300 nt-1.23□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YDR220CYDR220C 294 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YER188C-AYER188C-A 300 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 ACF4YJR083C 930 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 CMC1YKL137W 336 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 BER1YLR412W 825 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YOR364WYOR364W 369 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.26□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.28□□□□□ -2.61
YOR008C-AQ3E7B9 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-1.29□□□□□ -2.62
YOR008C-AQ3E7B9 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.8 ms