Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISXQ2M1V0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISXQ2M1V0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms