Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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