Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMPG1Q17R60 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMPG1Q17R60 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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