Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms