Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms