Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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