Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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