Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms