Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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