Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms