Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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