Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX2Q14781 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms