Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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