Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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