Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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