Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms