Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUL4AQ13619 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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