Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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