Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRQ13535 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRQ13535 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATRQ13535 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRQ13535 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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