Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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