Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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