Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms