Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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