Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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