Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDC16Q13042 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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