Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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