Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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