Protein–RNA interactions for Protein: Q12416

WHI5, G1-specific transcriptional repressor WHI5, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WHI5Q12416 SLH1YGR271W 5904 nt2.34□□□□□ -2.03
WHI5Q12416 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.34□□□□□ -2.03
WHI5Q12416 ATG9YDL149W 2994 nt2.34□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 HIR3YJR140C 4947 nt2.34□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 SEC26YDR238C 2922 nt2.33□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 MGA2YIR033W 3342 nt2.33□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 NEW1YPL226W 3591 nt2.33□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 YJR039WYJR039W 3366 nt2.32□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 TOR2YKL203C 7425 nt2.32□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 PDR8YLR266C 2106 nt2.32□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 TOR1YJR066W 7413 nt2.31□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 SPO24YPR036W-A 204 nt2.31□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 BNI1YNL271C 5862 nt2.31□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 EMC5YIL027C 426 nt2.3□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 HAL9YOL089C 3093 nt2.29□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 NUM1YDR150W 8247 nt2.29□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 DNF1YER166W 4716 nt2.28□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 SDH6YDR379C-A 240 nt2.28□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 YBR206WYBR206W 324 nt2.28□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.28□□□□□ -2.04
WHI5Q12416 LHS1YKL073W 2646 nt2.27□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 YGR164WYGR164W 336 nt2.27□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 NUT1YGL151W 3399 nt2.26□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 KIP1YBL063W 3336 nt2.26□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 APL1YJR005W 2103 nt2.26□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 COY1YKL179C 2040 nt2.26□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 SNU13YEL026W 381 nt2.26□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 PMP1YCR024C-A 123 nt2.25□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 COA4YLR218C 453 nt2.25□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 APL5YPL195W 2799 nt2.25□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 RAD50YNL250W 3939 nt2.24□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 MMS4YBR098W 2076 nt2.24□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 RGA1YOR127W 3024 nt2.24□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 YLL054CYLL054C 2532 nt2.24□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 MBB1YJL199C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.22□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 YDL206WYDL206W 2289 nt2.22□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 SAC3YDR159W 3906 nt2.22□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 SVL3YPL032C 2478 nt2.22□□□□□ -2.05
WHI5Q12416 PAN2YGL094C 3348 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 ALY2YJL084C 3141 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 TMA7YLR262C-A 195 nt2.21□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 ARP8YOR141C 2646 nt2.2□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 FKS3YMR306W 5358 nt2.2□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 SMC1YFL008W 3678 nt2.2□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 UFD2YDL190C 2886 nt2.2□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 STE11YLR362W 2154 nt2.19□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 TTI1YKL033W 3117 nt2.18□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 YOL098CYOL098C 3114 nt2.18□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 SKI3YPR189W 4299 nt2.18□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 PAA1YDR071C 576 nt2.18□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 YNL211CYNL211C 261 nt2.18□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.17□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 CTF4YPR135W 2784 nt2.17□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 GYP5YPL249C 2685 nt2.16□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 PDR1YGL013C 3207 nt2.16□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 RSM22YKL155C 1887 nt2.16□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 VPS13YLL040C 9435 nt2.16□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 RPS30BYOR182C 192 nt2.16□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 PRP42YDR235W 1635 nt2.16□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 DNA2YHR164C 4569 nt2.15□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 SEC16YPL085W 6588 nt2.15□□□□□ -2.06
WHI5Q12416 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.15□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 COX12YLR038C 252 nt2.15□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 SLX4YLR135W 2247 nt2.15□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 TRA1YHR099W 11235 nt2.15□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YCS4YLR272C 3531 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YPL044CYPL044C 549 nt2.14□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 SPP41YDR464W 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.12□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 PDR11YIL013C 4236 nt2.11□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.11□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YOR055WYOR055W 435 nt2.11□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 SGS1YMR190C 4344 nt2.11□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 UBP2YOR124C 3819 nt2.11□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YLR422WYLR422W 5799 nt2.1□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 MSB1YOR188W 3414 nt2.1□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.1□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.1□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.1□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.09□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.09□□□□□ -2.07
WHI5Q12416 snR70snR70 164 nt2.08□□□□□ -2.08
WHI5Q12416 PDR3YBL005W 2931 nt2.07□□□□□ -2.08
WHI5Q12416 SMC4YLR086W 4257 nt2.07□□□□□ -2.08
WHI5Q12416 YAR009CYAR009C 3591 nt2.07□□□□□ -2.08
WHI5Q12416 IRA2YOL081W 9240 nt2.07□□□□□ -2.08
WHI5Q12416 YOR102WYOR102W 351 nt2.07□□□□□ -2.08
WHI5Q12416 KCS1YDR017C 3153 nt2.07□□□□□ -2.08
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