Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 RPL34BYIL052C 366 nt2.08□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.08□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YOR218CYOR218C 420 nt2.08□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 RLM1YPL089C 2031 nt2.08□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 MYO4YAL029C 4416 nt2.07□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 SFB2YNL049C 2631 nt2.07□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 snR46snR46 197 nt2.07□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 TFC8YPL007C 1767 nt2.07□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 HIR3YJR140C 4947 nt2.07□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 MEC1YBR136W 7107 nt2.07□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 NOC3YLR002C 1992 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 NUP192YJL039C 5052 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 RAD34YDR314C 2079 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 RPS25BYLR333C 327 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YOR345CYOR345C 351 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YBR174CYBR174C 315 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 snR52snR52 92 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 MSH5YDL154W 2706 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 SEC63YOR254C 1992 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 MSC6YOR354C 2079 nt2.05□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 COF1YLL050C 432 nt2.04□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YNL144CYNL144C 2223 nt2.04□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 SEY1YOR165W 2331 nt2.04□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YOR170WYOR170W 306 nt2.04□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 ZIP2YGL249W 2115 nt2.03□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 DNF3YMR162C 4971 nt2.03□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 PAU3YCR104W 375 nt2.03□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 ECM12YHR021W-A 456 nt2.03□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 TRM3YDL112W 4311 nt2.03□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 YOR093CYOR093C 4947 nt2.03□□□□□ -2.08
CLF1Q12309 MCM10YIL150C 1716 nt2.03□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 CFT1YDR301W 4074 nt2.02□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 IRE1YHR079C 3348 nt2.02□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 YNL170WYNL170W 396 nt2.02□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 ZIP1YDR285W 2628 nt2.02□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 APL2YKL135C 2181 nt2.01□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 YHR210CYHR210C 1026 nt2.01□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 MDS3YGL197W 4464 nt2.01□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 MAD1YGL086W 2250 nt2□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 PKH3YDR466W 2697 nt2□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 CTR9YOL145C 3234 nt2□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 YJR039WYJR039W 3366 nt1.99□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 IRC20YLR247C 4671 nt1.99□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 ULI1YFR026C 510 nt1.99□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 PMP1YCR024C-A 123 nt1.98□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.98□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 TDA9YML081W 3756 nt1.98□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 MSH6YDR097C 3729 nt1.97□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 RPL33BYOR234C 324 nt1.97□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 SAS3YBL052C 2496 nt1.97□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 AHC1YOR023C 1701 nt1.97□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.97□□□□□ -2.09
CLF1Q12309 ANS1YHR126C 480 nt1.96□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YBL053WYBL053W 375 nt1.96□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 MLH3YPL164C 2148 nt1.96□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 BRR2YER172C 6492 nt1.96□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 RTP1YMR185W 2946 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YDL196WYDL196W 330 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 SDH6YDR379C-A 240 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 MAK10YEL053C 2202 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 PIG1YLR273C 1947 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 COY1YKL179C 2040 nt1.95□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 FIG2YCR089W 4830 nt1.94□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 FRK1YPL141C 2598 nt1.94□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 DCP2YNL118C 2913 nt1.94□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 VPS15YBR097W 4365 nt1.93□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 DGR2YKL121W 2559 nt1.93□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.93□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YBR206WYBR206W 324 nt1.93□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.93□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 HMI1YOL095C 2121 nt1.93□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.92□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YLL007CYLL007C 1998 nt1.92□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 ADR1YDR216W 3972 nt1.91□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YDR521WYDR521W 336 nt1.91□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.91□□□□□ -2.1
CLF1Q12309 YIR044CYIR044C 186 nt1.9□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 CAT8YMR280C 4302 nt1.9□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 CUL3YGR003W 2235 nt1.89□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.89□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 CHS1YNL192W 3396 nt1.89□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 MON2YNL297C 4911 nt1.89□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 IFH1YLR223C 3258 nt1.88□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 ALK1YGL021W 2283 nt1.88□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 MSH3YCR092C 3057 nt1.88□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 SBE22YHR103W 2559 nt1.88□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.88□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 YGR164WYGR164W 336 nt1.88□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 Q0143Q0143 153 nt1.87□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 FIG4YNL325C 2640 nt1.87□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 COA6YMR244C-A 315 nt1.86□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 TBS1YBR150C 3285 nt1.86□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 COG4YPR105C 2586 nt1.86□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 UTP21YLR409C 2820 nt1.85□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 YOR019WYOR019W 2193 nt1.85□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 PIP2YOR363C 2991 nt1.85□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 AIM44YPL158C 2277 nt1.85□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 HAL9YOL089C 3093 nt1.85□□□□□ -2.11
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