Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 IRC23YOR044W 474 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YOR121CYOR121C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YAR009CYAR009C 3591 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 WAR1YML076C 2835 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 SPT7YBR081C 3999 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 PCC1YKR095W-A 267 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 VAM6YDL077C 3150 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 NIP100YPL174C 2607 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 MAM33YIL070C 801 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 PTP2YOR208W 2253 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YDR426CYDR426C 378 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 RPL34BYIL052C 366 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 TTI1YKL033W 3117 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 GEA2YEL022W 4380 nt1.03□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 IML1YJR138W 4755 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 YLL007CYLL007C 1998 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 KAP120YPL125W 3099 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 YHL042WYHL042W 453 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 YDR157WYDR157W 402 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 YJR011CYJR011C 786 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 BUD3YCL014W 4911 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 CSN9YDR179C 489 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 SMC1YFL008W 3678 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN5Q12250 YDR521WYDR521W 336 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 ISD11YER048W-A 285 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 YAR053WYAR053W 297 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 YDL196WYDL196W 330 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 HMRA2YCR096C 360 nt0.92□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 DBP6YNR038W 1890 nt0.92□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 ALG13YGL047W 609 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 YGR035CYGR035C 351 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 YOR282WYOR282W 321 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 BIL1YOR304C-A 231 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN5Q12250 YBR206WYBR206W 324 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YPR117WYPR117W 7470 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 OST1YJL002C 1431 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YAR029WYAR029W 225 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 IES4YOR189W 351 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 BEM2YER155C 6504 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YCK3YER123W 1575 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YFL019CYFL019C 354 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 HTB2YBL002W 396 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YBR064WYBR064W 429 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 RPL35AYDL191W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 ECM12YHR021W-A 456 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 RKR1YMR247C 4689 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YDR344CYDR344C 444 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 OLI1Q0130 231 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YPL044CYPL044C 549 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 DOP1YDR141C 5097 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YLR334CYLR334C 381 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 YDL073WYDL073W 2955 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN5Q12250 SPO21YOL091W 1830 nt0.83□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 PMP1YCR024C-A 123 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 YDR048CYDR048C 315 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 PAA1YDR071C 576 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 NOP9YJL010C 2001 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 BFR2YDR299W 1605 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 RPS25BYLR333C 327 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 CMC4YMR194C-B 222 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 MCM10YIL150C 1716 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 YJL120WYJL120W 324 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN5Q12250 PAM16YJL104W 450 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 TAR1YLR154W-C 375 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YOR029WYOR029W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YPR012WYPR012W 255 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 PRP16YKR086W 3216 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 SSS1YDR086C 243 nt0.76□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 RPL26BYGR034W 384 nt0.76□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 SEC1YDR164C 2175 nt0.76□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YMR321CYMR321C 318 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 SGF11YPL047W 300 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YPL225WYPL225W 441 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 LTE1YAL024C 4308 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 NPR2YEL062W 1848 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YAF9YNL107W 681 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YNL211CYNL211C 261 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 YPR197CYPR197C 564 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN5Q12250 CHS6YJL099W 2241 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN5Q12250 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN5Q12250 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.1 ms