Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 CYR1YJL005W 6081 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 AMS1YGL156W 3252 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 ESL2YKR096W 3588 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YML002WYML002W 2214 nt2.81□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YDL206WYDL206W 2289 nt2.81□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 MLH1YMR167W 2310 nt2.8□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.8□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 NEW1YPL226W 3591 nt2.8□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 IFH1YLR223C 3258 nt2.8□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 BIR1YJR089W 2865 nt2.79□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 PTP3YER075C 2787 nt2.79□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 NOP9YJL010C 2001 nt2.79□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 SLN1YIL147C 3663 nt2.78□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.78□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 RGM1YMR182C 636 nt2.78□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 LHS1YKL073W 2646 nt2.78□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 SBE22YHR103W 2559 nt2.78□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 RTT10YPL183C 3042 nt2.78□□□□□ -1.96
PUS1Q12211 DNL4YOR005C 2835 nt2.78□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.77□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 RPO41YFL036W 4056 nt2.77□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 NAM7YMR080C 2916 nt2.76□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 SGS1YMR190C 4344 nt2.76□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 SEC26YDR238C 2922 nt2.76□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 YFR016CYFR016C 3702 nt2.76□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 TTI1YKL033W 3117 nt2.76□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 SVL3YPL032C 2478 nt2.76□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 CRM1YGR218W 3255 nt2.75□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 YPR097WYPR097W 3222 nt2.75□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 snR47snR47 99 nt2.75□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 SPF1YEL031W 3648 nt2.75□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 YDR186CYDR186C 2634 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 PSD2YGR170W 3417 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 KAP120YPL125W 3099 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 NOP10YHR072W-A 177 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 HRD3YLR207W 2502 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 SWI5YDR146C 2130 nt2.74□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 MAK10YEL053C 2202 nt2.73□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 RTT107YHR154W 3213 nt2.73□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 snR76snR76 109 nt2.73□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.73□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 CRS5YOR031W 210 nt2.73□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 INP51YIL002C 2841 nt2.72□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 SEC1YDR164C 2175 nt2.72□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 MLH3YPL164C 2148 nt2.72□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 IRR1YIL026C 3453 nt2.72□□□□□ -1.97
PUS1Q12211 INP53YOR109W 3324 nt2.71□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 YDR210WYDR210W 228 nt2.71□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 UBP11YKR098C 2154 nt2.71□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 PDR1YGL013C 3207 nt2.71□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 NUM1YDR150W 8247 nt2.71□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 STB4YMR019W 2850 nt2.71□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 PAU8YAL068C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 PAU18YLL064C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.7□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 PAU6YNR076W 363 nt2.7□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 PAU20YOL161C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 EAF1YDR359C 2949 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 YLL020CYLL020C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 SIR4YDR227W 4077 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 TIM9YEL020W-A 264 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 APL2YKL135C 2181 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 YLR232WYLR232W 348 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 CBF2YGR140W 2871 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 NUP157YER105C 4176 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 PSK2YOL045W 3306 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 SNC1YAL030W 354 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 SPO22YIL073C 2928 nt2.65□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 RRP12YPL012W 3687 nt2.65□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 NUP100YKL068W 2880 nt2.65□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 YEF3YLR249W 3135 nt2.65□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 ARP8YOR141C 2646 nt2.65□□□□□ -1.98
PUS1Q12211 TRA1YHR099W 11235 nt2.65□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 VTC3YPL019C 2508 nt2.65□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.64□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 AFI1YOR129C 2682 nt2.64□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.64□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 ACB1YGR037C 264 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 MDS3YGL197W 4464 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 ENV11YGR071C 2583 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 RGA1YOR127W 3024 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 REV3YPL167C 4515 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 PRP6YBR055C 2700 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 PDR11YIL013C 4236 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 TOR1YJR066W 7413 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 TAH1YCR060W 336 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 MMS4YBR098W 2076 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 SCP160YJL080C 3669 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 RIC1YLR039C 3171 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 NUP170YBL079W 4509 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 YKL225WYKL225W 348 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS1Q12211 KSP1YHR082C 3090 nt2.59□□□□□ -2
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