Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms