Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms