Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms