Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB2Q08289 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms