Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.94□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 POL3YDL102W 3294 nt2.94□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 VAS1YGR094W 3315 nt2.93□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 PMR1YGL167C 2853 nt2.93□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 STT4YLR305C 5703 nt2.93□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 TBS1YBR150C 3285 nt2.92□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 BUD2YKL092C 3315 nt2.92□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 ILS1YBL076C 3219 nt2.92□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 SAP185YJL098W 3177 nt2.92□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 YIL169CYIL169C 2988 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 SPO71YDR104C 3738 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 SCP160YJL080C 3669 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 snR47snR47 99 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 YJR039WYJR039W 3366 nt2.91□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 SLI15YBR156C 2097 nt2.9□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 snR75snR75 89 nt2.9□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 JSN1YJR091C 3276 nt2.9□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.89□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.89□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 INP51YIL002C 2841 nt2.88□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YLR232WYLR232W 348 nt2.88□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 CBF2YGR140W 2871 nt2.87□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 DBP10YDL031W 2988 nt2.87□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 RSM22YKL155C 1887 nt2.86□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 ADR1YDR216W 3972 nt2.86□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 MSH5YDL154W 2706 nt2.86□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 FRK1YPL141C 2598 nt2.86□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 SIN3YOL004W 4611 nt2.85□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.85□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 ASE1YOR058C 2658 nt2.85□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 RTP1YMR185W 2946 nt2.84□□□□□ -1.95
BUD20Q08004 SSN2YDR443C 4263 nt2.83□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 YML002WYML002W 2214 nt2.83□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 VPS8YAL002W 3825 nt2.83□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 RPA190YOR341W 4995 nt2.83□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 MRD1YPR112C 2664 nt2.83□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 SEC26YDR238C 2922 nt2.82□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 SVL3YPL032C 2478 nt2.82□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 ORC3YLL004W 1851 nt2.82□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 FLO1YAR050W 4614 nt2.81□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 YPL216WYPL216W 3309 nt2.81□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 MDS3YGL197W 4464 nt2.8□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 CDC60YPL160W 3273 nt2.8□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 AGC1YPR021C 2709 nt2.8□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 RIF1YBR275C 5751 nt2.79□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 PNC1YGL037C 651 nt2.79□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 MBB1YJL199C 327 nt2.79□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.79□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 POL5YEL055C 3069 nt2.78□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 YLR278CYLR278C 4026 nt2.78□□□□□ -1.96
BUD20Q08004 NUP100YKL068W 2880 nt2.77□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 TAO3YIL129C 7131 nt2.77□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 SEC21YNL287W 2808 nt2.76□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 CAF120YNL278W 3183 nt2.75□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 RAX2YLR084C 3663 nt2.75□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 LCL1YPL056C 306 nt2.75□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 GCN2YDR283C 4980 nt2.74□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 SLH1YGR271W 5904 nt2.74□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 AMS1YGL156W 3252 nt2.74□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.74□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 CTR9YOL145C 3234 nt2.73□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 ESL1YIL151C 3357 nt2.73□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 SNQ2YDR011W 4506 nt2.72□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 BPT1YLL015W 4680 nt2.72□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 NOP9YJL010C 2001 nt2.72□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 AXL1YPR122W 3627 nt2.72□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 MET18YIL128W 3099 nt2.72□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 TRM3YDL112W 4311 nt2.72□□□□□ -1.97
BUD20Q08004 TUS1YLR425W 3924 nt2.71□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 SEC7YDR170C 6030 nt2.7□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 SEY1YOR165W 2331 nt2.7□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 RSE1YML049C 4086 nt2.69□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 DYN1YKR054C 12279 nt2.69□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 TIM9YEL020W-A 264 nt2.69□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.69□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 COA6YMR244C-A 315 nt2.69□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 MMS4YBR098W 2076 nt2.69□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 RPM2YML091C 3609 nt2.68□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 YLR041WYLR041W 321 nt2.67□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 ECM29YHL030W 5607 nt2.67□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 IRE1YHR079C 3348 nt2.67□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 MOT1YPL082C 5604 nt2.66□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 TCB2YNL087W 3537 nt2.66□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 SEC10YLR166C 2616 nt2.66□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 YKL225WYKL225W 348 nt2.66□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 UFD4YKL010C 4452 nt2.66□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 NUP157YER105C 4176 nt2.66□□□□□ -1.98
BUD20Q08004 RAD9YDR217C 3930 nt2.65□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 RPS29AYLR388W 171 nt2.65□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 YEF3YLR249W 3135 nt2.65□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 MYO2YOR326W 4725 nt2.64□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 YPR097WYPR097W 3222 nt2.64□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 ALY2YJL084C 3141 nt2.64□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 PDR3YBL005W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 SMC1YFL008W 3678 nt2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.5 ms