Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms