Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms