Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3AQ05086 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3AQ05086 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3AQ05086 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms