Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	ISF1	YMR081C	1017 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	YAP6	YDR259C	1152 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	POL32	YJR043C	1053 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YMR090W	Q04304	YBR063C	YBR063C	1215 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	SNU56	YDR240C	1479 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	MYO1	YHR023W	5787 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	snR46	snR46	197 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	HTB1	YDR224C	396 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	LOC1	YFR001W	615 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	CWC23	YGL128C	852 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YOR248W	YOR248W	303 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	SPO21	YOL091W	1830 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YOL160W	YOL160W	342 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	RAD34	YDR314C	2079 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YDR220C	YDR220C	294 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	SRB7	YDR308C	423 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YMR090W	Q04304	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	HTB2	YBL002W	396 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YPL225W	YPL225W	441 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YIR044C	YIR044C	186 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YJL007C	YJL007C	315 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	PBI2	YNL015W	228 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YPL261C	YPL261C	309 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	IRC16	YPR038W	360 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	snR34	snR34	203 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	NIP100	YPL174C	2607 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YMR090W	Q04304	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	YML108W	YML108W	318 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	VAM3	YOR106W	852 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	UBS1	YBR165W	834 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	DCP1	YOL149W	696 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YMR090W	Q04304	YLR171W	YLR171W	390 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	snR72	snR72	98 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YGL015C	YGL015C	393 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YGL239C	YGL239C	315 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YPR096C	YPR096C	303 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	BUD26	YDR241W	288 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	UTP8	YGR128C	2142 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	ILM1	YJR118C	612 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	YKL202W	YKL202W	582 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	ECL1	YGR146C	636 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
YMR090W	Q04304	DIE2	YGR227W	1578 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	APQ13	YJL075C	417 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	RPS20	YHL015W	366 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	YPR039W	YPR039W	336 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	RPM2	YML091C	3609 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YMR090W	Q04304	YNL319W	YNL319W	441 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	MRPL32	YCR003W	552 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	IPP1	YBR011C	864 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YCR022C	YCR022C	345 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YGR228W	YGR228W	345 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	SVS1	YPL163C	783 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	snR51	snR51	107 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YER135C	YER135C	393 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YGR115C	YGR115C	780 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YOL029C	YOL029C	606 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	snR33	snR33	183 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	ATG31	YDR022C	591 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YLR217W	YLR217W	324 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YMR090W	Q04304	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	RPF1	YHR088W	888 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	GLG1	YKR058W	1851 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	BER1	YLR412W	825 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	snR5	snR5	204 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	SDH7	YDR511W	402 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	YJL120W	YJL120W	324 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	YPL182C	YPL182C	384 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YMR090W	Q04304	YBR099C	YBR099C	384 nt		-1.15	□□□□□ -2.59

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.7 ms