Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 TOR2YKL203C 7425 nt2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 RPL31AYDL075W 342 nt2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YJL150WYJL150W 303 nt2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 ATG9YDL149W 2994 nt2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 PEP1YBL017C 4740 nt2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 MGA2YIR033W 3342 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 HIR3YJR140C 4947 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 TMA7YLR262C-A 195 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 TRM3YDL112W 4311 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 YNL144CYNL144C 2223 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 FKS1YLR342W 5631 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.27□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 HSL1YKL101W 4557 nt2.26□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 PDR8YLR266C 2106 nt2.26□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.26□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 snR46snR46 197 nt2.26□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 MYO4YAL029C 4416 nt2.26□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 PRP39YML046W 1890 nt2.26□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 SFB2YNL049C 2631 nt2.25□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 UBP2YOR124C 3819 nt2.25□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 ULI1YFR026C 510 nt2.25□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 FAB1YFR019W 6837 nt2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 USO1YDL058W 5373 nt2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 SLI15YBR156C 2097 nt2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 YDR521WYDR521W 336 nt2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 UTP21YLR409C 2820 nt2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 SPP41YDR464W 4308 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 YGL217CYGL217C 342 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 COF1YLL050C 432 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 ALK1YGL021W 2283 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 NCA2YPR155C 1851 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 IFH1YLR223C 3258 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 TRS65YGR166W 1683 nt2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q02979 NEO1YIL048W 3456 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 PIP2YOR363C 2991 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 PAU3YCR104W 375 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 YJR039WYJR039W 3366 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 PBY1YBR094W 2262 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 YCS4YLR272C 3531 nt2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 NUT1YGL151W 3399 nt2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 YNL338WYNL338W 159 nt2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 COG4YPR105C 2586 nt2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 KIP1YBL063W 3336 nt2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 GCN2YDR283C 4980 nt2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 PKH2YOL100W 3246 nt2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 AIM44YPL158C 2277 nt2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 Q0092Q0092 141 nt2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 EMC5YIL027C 426 nt2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 LRE1YCL051W 1752 nt2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 YDL196WYDL196W 330 nt2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 SPO24YPR036W-A 204 nt2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 SLD3YGL113W 2007 nt2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 TBS1YBR150C 3285 nt2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q02979 YHR210CYHR210C 1026 nt2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 ADR1YDR216W 3972 nt2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 HAL9YOL089C 3093 nt2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 AHC1YOR023C 1701 nt2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 ALY2YJL084C 3141 nt2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 FIG4YNL325C 2640 nt2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 YBR206WYBR206W 324 nt2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 KCS1YDR017C 3153 nt2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 LHS1YKL073W 2646 nt2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 ANS1YHR126C 480 nt2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 SKI3YPR189W 4299 nt2.11□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 YOR345CYOR345C 351 nt2.11□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 snR52snR52 92 nt2.11□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 RPL33BYOR234C 324 nt2.1□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 SBE22YHR103W 2559 nt2.1□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 PAN2YGL094C 3348 nt2.09□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.09□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.09□□□□□ -2.07
GDE1Q02979 YEL073CYEL073C 324 nt2.08□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.08□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.07□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.07□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 UFD2YDL190C 2886 nt2.05□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YLR422WYLR422W 5799 nt2.05□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 ATP8Q0080 147 nt2.05□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.05□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 RAD50YNL250W 3939 nt2.05□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.04□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YDL206WYDL206W 2289 nt2.04□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.04□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 BRR2YER172C 6492 nt2.04□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 PKH3YDR466W 2697 nt2.04□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 MMS4YBR098W 2076 nt2.03□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YMR045CYMR045C 5268 nt2.03□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.03□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 UBR2YLR024C 5619 nt2.03□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 COY1YKL179C 2040 nt2.03□□□□□ -2.08
GDE1Q02979 IRC20YLR247C 4671 nt2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 APL1YJR005W 2103 nt2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 YOR170WYOR170W 306 nt2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 PMP1YCR024C-A 123 nt2□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 YLL054CYLL054C 2532 nt2□□□□□ -2.09
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