Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms